gms | German Medical Science

Die molekulare Charakterisierung von Meningokokken dient seit mehreren Jahrzehnten der Identifikation und Bestätigung von Infektketten, der Charakterisierung global verbreiteter Meningokokkenlinien, der Abschätzung des Virulenzpotenzials sowie der Charakterisierung von Impfantigenen und Antibiotikaresistenzdeterminanten. Für all diese Determinanten konnten Typisierungsschemata entwickelt werden, die auf PCR und DNA-Sequenzierung beruhen [1]. U.a. durch die enge Vernetzung mit europäischen Referenzlaboratorien innerhalb der EMGM Society und dem ECDC Netzwerk IBD Labnet hat die Universität Oxford eine einheitliche Datenbankplattform entwickeln können, die mittlerweile auch Genomsequenzen abdeckt [2]. Die Datenbankstruktur und die konsequente Anwendung durch alle Referenzlaboratorien sorgt für eine Harmonisierung der Typisierung von Meningokokken. Da die klassische Typisierung durch PCR und DNA-Sequenzierung den oben genannten Anforderungen an die Typisierung üblicherweise genügt, wird derzeit der Übergang zur Genomsequenzierung genutzt, um die Informationen über einen Stamm schneller, mit geringerem Arbeitsaufwand und ggf. kostengünstiger zu erhalten. Die MRF meningococcus genome library (http://www.meningitis.org/research/genome) zeigt für das englische Referenzlabor, dass bei ausreichender Infrastruktur und Finanzierung eine vollständige Umstellung der Typisierung auf Genomsequenzierung möglich ist. Derzeit geht dies allerdings noch auf Kosten der Schnelligkeit, die am deutschen Referenzlabor z.B. zur Clusteridentifikation gewünscht wird [3]. Der EMGM Workshop on Implementation of Genome Sequencing (http://emgm.eu/) soll Ende des Jahres eine Plattform bieten, um die weitere Entwicklung innerhalb der Referenzlaboratorien zu steuern. Der Nutzen der hohen Auflösung der Genomsequenzierung über die Standardtypisierung hinaus soll im Vortrag anhand eines Meningokokken C Ausbruchs bei MSM, der kürzlich beschrieben wurde [4], verdeutlicht werden.