gms | German Medical Science

Einleitung: Das Portal Medical-Data-Models.org [1], [2] ist das weltweit größte Open-Access-Portal für medizinische Datenmodelle im CDISC Operational Data Model Format (ODM) [3]. Derzeit sind 486 aktive nicht-priviligierte Benutzer registriert und es stehen 15 verschiedene Download-Formate für Datenmodelle zur Verfügung, die in lokalen Systemen genutzt werden können. Im Folgenden soll untersucht werden, welche Formate von den Nutzern bei dem Export aus dem System bevorzugt werden.

Methoden: Diese Ausgabeformate werden während des Zugriffes erzeugt. Die notwendigen Routinen sind modular als Webservice an das Portal angebunden. Neue Konverter können so effizient implementiert werden.

Für die Einbindung eines neuen Konverters muss lediglich in einer Konfigurationsdatei der Name des neuen Konverters und die Webadresse, unter der dieser erreichbar ist, definiert werden. Die Programmiersprache ist unerheblich. Aktuell existieren Konverter auf Basis von R, Ruby, Perl und Java.

Obwohl die Konverter per Web-Schnittstelle eingebunden sind, wird jede Anfrage über das Portal als Proxy bearbeitet. Jeder Download-Vorgang wird in einer mySQL-Datenbank protokolliert.

Für die Auswertung wurden alle Einträge von Benutzern ohne Moderations- oder Administrationsrechte zwischen dem 1. Juli 2015 und dem 29. Februar 2016 betrachtet.

Ergebnisse: Aktuell sind 15 verschiedene Konverter angebunden. Zwischen dem 1. Juli 2015 und dem 29. April 2016 wurden 188 verschiedene Formulare in 540 Vorgängen herunter geladen. Das ODM-Format wurde 183 mal (34% der Vorgänge) genutzt, das REDCap-Format 73 mal (14%). Die weiterhin genutzten Formate waren PDF (11%) und PDF mit Benutzerkommentaren (7%). Erst darauf folgten CSV (6%) und Excel/XSLX (6%).

Zusammenfassung und Ausblick: Die Vielfalt der genutzten Download-Formate zeigt, dass es kein Format für den Export von Datenmodellen, speziell Studienmetadaten, aus dem Medical-Data-Models-Portal vorherrscht. Obwohl beispielsweise das REDCap-Format erst seit Anfang 2015 zur Verfügung steht und das Portal als Quelle für Studienformulare erst seit Anfang 2016 von der Software REDCap eingebunden wird, ist es aktuell mit 14% bereits das am zweithäufigsten benutzte Export-Format [4].

Besonders im Bereich der Studienplanung und Erstellung von medizinischen Fragebögen ist es wichtig, auf bereits vorhandene Arbeit zurückgreifen zu können. Wegen der Software-Vielfalt ist es essentiell, Datenmodelle in verschiedenen Formaten bereit zu stellen.

Durch die vorgestellten technischen Rahmenbedingungen ist die Einbindung neuer Konverter zügig möglich. Im Februar 2016 wurde ein Konverter für die Ausgabe als FHIR Questionnaire [5] eingebunden. Konverter in das Limesurvey-Umfrageformat [6] und OpenDataKit-Format [7] befinden sich aktuell in Planung und Entwicklung.

Eine im Januar 2016 gestartete Umfrage unter den Nutzern des Systems soll weitere Export-, aber auch Import-Formate identifizieren.