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Identifizierung von obligaten Anaerobiern der Bacteroides fragilis Gruppe einschließlich Metronidazol-resistenter und Enterotoxin-positiver Stämme mittels MALDI-TOF MS
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Authors
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Kevin Dallacker-Losensky
- BwKrhs Ulm, Unfallchirurgie und Orthopädie, Ulm, Germany
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Hans-Joachim Riesner
- Bundeswehrkrankenhaus Ulm, Unfallchirurgie/Orthopädie, Ulm, Germany
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Patrick Hoth
- Bundeswehrkrankenhaus Ulm, Klinik für Unfallchirurgie und Orthopädie, Rekonstruktive und Septische Chirurgie, Sporttraumatologie, Ulm, Germany
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Gerhard Achatz
- Bundeswehrkrankenhaus Ulm, Klinik für Unfallchirurgie und Orthopädie, Rekonstruktive und Septische Chirurgie, Sporttraumatologie, Ulm, Germany
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Reiner Schaumann
- Institut für Mikrobiologie Universität Leipzig, Leipzig, Germany
| Published: | October 25, 2022 |
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Fragestellung: Die klassische Identifizierung von obligat anaeroben Bakterien ist mit einem hohen Labor- und Zeitaufwand verbunden. Um festzustellen, ob die Identifizierung mittels Matrix-unterstützter Laser-Desorption/Ionisation und Massenspektrometrie mit Flugzeitanalysator (Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry; MALDI-TOF MS) ein Verfahren ist, um obligate Anaerobier eindeutig zu identifizieren, wurde mit der vorliegenden Arbeit die Identifizierung von unterschiedlichen Spezies der B. fragilis Gruppe mittels MALDI-TOF MS untersucht.
Methodik: Es wurden 105 Stämme der B. fragilis Gruppe als obligate Anaerobier aus der Stammsammlung des Institutes für Medizinische Mikrobiologie und Infektionsepidemiologie der Universität Leipzig untersucht, einschließlich Metronidazol-resistenter und pathogener Stämme.
Es fanden sich für alle untersuchten Erreger Spektren mit sehr guter Auflösung. Eine Identifizierung und Differenzierung war auf dieser Basis damit eindeutig möglich. Unter Verwendung dieser Daten wurde eine Referenzdatenbank erstellt. Die erhaltenen Ergebnisse wurden mittels einer verblindeten Studie überprüft.
Ergebnisse und Schlussfolgerung: Es konnten 52 von 53 (98,1%) der blind untersuchten Stämme auf Basis der Referenzdatenbank eindeutig identifiziert werden. Dies schließt ebenfalls die Identifizierung und Differenzierung von 15 Metronidazol-sensiblen/ Enterotoxin-negativen, 8 Metronidazol-resistenten/ Enterotoxin-negativen und 8 Metronidazol-sensiblen/ Enterotoxin-positiven B. fragilis Stämmen ein.
Die Identifizierung mittels MALDI-TOF MS ist somit eine zuverlässige Methode zur Identifizierung von obligaten Anaerobiern der B. fragilis Gruppe. Weiterhin finden sich Hinweise, dass ein Nachweis von Resistenz-, Virulenz- und Pathogenitätsfaktoren mittels MALDI-TOF MS bei diesen Erregern ebenfalls eindeutig möglich ist.
