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GMDS 2014: 59. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie e. V. (GMDS)

Deutsche Gesellschaft für Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie

07. - 10.09.2014, Göttingen

Metadata Repositories und Metadaten-getriebene Systeme in der Biomedizinischen Forschung

Meeting Abstract

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  • M. Löbe - Universität Leipzig, Leipzig
  • J. Stausberg - Ludwig-Maximilians-Universität München, München
  • J. Drepper - TMF – Technologie- und Methodenplattform für die vernetzte medizinische Forschung e.V., Berlin

GMDS 2014. 59. Jahrestagung der Deutschen Gesellschaft für Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie e.V. (GMDS). Göttingen, 07.-10.09.2014. Düsseldorf: German Medical Science GMS Publishing House; 2014. DocAbstr. 57

doi: 10.3205/14gmds258, urn:nbn:de:0183-14gmds2586

Veröffentlicht: 4. September 2014

© 2014 Löbe et al.
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Gliederung

Text

Systeme zur strukturierten Verwaltung von Metadaten sind im Zeitalter von „Big Data“ ein wesentlicher Bestandteil jeder Forschungsinfrastruktur. Die darin enthaltenen Datenelemente, Formulare und Value Sets dienen als semantische Referenz für die Dokumentationskonzepte klinischer Studien, epidemiologischer Register, longitudinaler Kohorten, von Krankenhausinformationssystemen oder Projekten der Versorgungsforschung. Ohne vollständige und eindeutige Beschreibung der Primärdaten mit Metadaten ist deren extensive, dauerhafte Nutzung nicht möglich.

Die Spezifikation von qualitativ hochwertigen Metadaten ist jedoch ein komplexer Prozess, zu dessen Unterstützung in den letzten Jahren verschiedene Methoden und Softwaresysteme entwickelt wurden. Diese umfassen beispielsweise zentrale Datenbanken (Metadata Repositories), in denen Datenelemente für Forschungsvorhaben erstellt, diskutiert und freigegeben werden [1]. Hier lassen sich lokale Systeme (Data Dictionaries) mit standardisierten Prozessen und Konventionen und offene, Community-orientierte Systemen mit einem freieren Vorgehensmodell unterscheiden. Zum letzteren Typ gehört das Nationale Metadata Repository [2].

Definition, Bezeichnung und Kodierung von Datenelementen sowie von Value Sets können aber auch aus medizinischen Terminologien entnommen werden. Prominentestes Beispiel ist SNOMED-CT. Durch den Einsatz von medizinischen Terminologien ist die semantische Interoperabilität einer strukturierten Dokumentation gewährleistet: für die Kommunikation in der Versorgung (z. B. zwischen Krankenhäusern und Arztpraxen), für die mehrfache Nutzung von Daten in der Forschung (z. B. bei der Verknüpfung von Registern und klinischen Studien) oder für die Einbettung von Versorgung und Forschung in einen internationalen Rahmen, z.B. bei multinationalen Studien.

Das Forum „Metadaten und Linked Data“ der TMF – Technologie- und Methodenplattform für die vernetzte medizinische Forschung [3] hat es sich zur Aufgabe gemacht, Ansätze zur Standardisierung von Metadaten zu beobachten und wenn möglich abzustimmen. Ziel des Workshops ist es, einen Überblick über aktuelle Entwicklungen im deutschsprachigen Raum zu gewinnen. Interessante Themen sind insbesondere konkrete Implementierungen, Erfahrungen von Anwendern aus dem Einsatz von Metadata Repositories in der Praxis, Erstellung und Harmonisierung von Metadatenkatalogen für spezifische Einsatzzwecke (Kerndatensätze), Zugriff auf Metadatenverzeichnisse und Verwendung in eigenen Anwendungen, Metriken und Verfahren zur Messung von Güte, Ähnlichkeit oder Nutzungsgrad von Metadaten-Artifakten sowie der Einsatz semantischer Technologien (RDF/OWL, Linked Data).


Literatur

1.
Stausberg J, Löbe M, Verplancke P, Drepper J, Herre H, Löffler M. Foundations of a metadata repository for databases of registers and trials. Studies in health technology and informatics. 2009;150:409-13. Available from: http://view.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19745342. Externer Link
2.
MDR. https://mdr.imise.uni-leipzig.de Externer Link
3.
TMF Arbeitsgruppen und Foren. https://www.tmf-ev.de/Arbeitsgruppen_Foren/ForumMetadaten.aspx Externer Link