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Drug-Disease-Networks: innovatives PubPharm-Recherchetool
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Christina Draheim
- Fachinformationsdienst Pharmazie der Universitätsbibliothek Braunschweig, Deutschland
| Published: | September 16, 2021 |
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In der engen Zusammenarbeit zwischen der Universitätsbibliothek und dem Institut für Informationssysteme (lflS) der Technischen Universität Braunschweig im Fachinformationsdienst Pharmazie entstehen innovative Recherchetools, die neue Zugriffspfade für unterschiedliche Informationsressourcen bieten. In der informatorischen Grundlagenforschung werden Prototypen entwickelt und diese von Fokusgruppen der Fachcommunity evaluiert. Erfolgreiche Services werden anschließend in die frei verfügbare, wirkstoffzentrierte Rechercheplattform PubPharm (https://www.pubpharm.de/) implementiert [1].
Mithilfe von künstlicher Intelligenz, im Detail mit neuronalen Netzen, können Beziehungen zwischen pharmazierelevanten Entitäten (Wirkstoffen, Erkrankungen und Gene) auf Basis von Forschungsliteratur ermittelt werden [2]. Aus dieser Forschungstätigkeit am IfIS ist bereits eine Funktion in PubPharm eingegangen: die Anzeige von Vorschlagslisten kontextähnlicher, verwandter Substanzen, Erkrankungen/Symptome und Gene bei einer Suche nach Wirkstoffen bzw. Erkrankungen. Eine Erweiterung dieser Funktion sind die neu integrierten Drug-Disease-Networks. Diese Visualisierung der z.T. komplexen Entitätsbeziehungen unterstützt deren Interpretation. Weiterführende Informationen können über Verlinkungen zu externen Datenquellen (u.a. Comparative Toxicogenomics Database und DrugBank) erhalten werden.
Dieser Vortrag bietet einen Überblick über die Entwicklung dieses neuen Service, von der Idee bis zum stabilen Dienst in PubPharm, sowie die Vorstellung der einzelnen Funktionen der interaktiven Drug-Disease-Networks.
Literatur
- 1.
- Keßler K, Kroll H, Wawrzinek J, Draheim C, Wulle S, Stump K, Balke W-T. PubPharm – Gemeinsam von der informationswissenschaftlichen Grundlagenforschung zum nachhaltigen Service. ABI Technik. 2019; 39(4):282-94. DOI: 10.1515/abitech-2019-4005
- 2.
- Wawrzinek J, Pinto J M G, Balke W-T. Linking Semantic Fingerprints of Literature - from Simple Neural Embeddings Towards Contextualized Pharmaceutical Networks. In: Doucet A, Isaac A, Golub K, Aalberg T, Jatowt A, Hrsg. Digital Libraries for Open Knowledge. 23rd International Conference on Theory and Practice of Digital Libraries, TPDL 2019, Oslo, Norway, September 9-12, 2019, Proceedings. Cham: Springer; 2019. p. 33-40. DOI: 10.1007/978-3-030-30760-8_3
