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Analyse der Genregulation von Mitgliedern der mitochondrialen Elektronentransportkette bei Patienten mit einem Nierenzellkarzinom
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Veröffentlicht: | 25. Februar 2016 |
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Fragestellung: Mitochondrien zeigen eine veränderte Aktivität beim Nierenzellkarzinom. Ziel der Studie ist ein besseres Verständnis der Veränderungen innerhalb der mitochondrialen Elektronentransportkette (ETK) durch Untersuchung der Expression der einzelnen Komponenten beim klarzelligen Nierenzellkarzinom (ccRCC).
Methodik: Zunächst erfolgte eine Analyse der Expression aller ETK Mitglieder (Komplex I NADH Dehydrogenase: n=50; Komplex II Succinat Dehydrogenase: n=4; Komplex III Cytochrom bc1: n=11; Komplex IV Cytochrom c Oxidase: n=34; Komplex V ATP Synthase: n=29) mittels Literaturrecherche von Microarray Expressionsprofiling Studien mithilfe der NextBio Datenbank. Im Anschluss erfolgte eine Validierung der RNA-Expression ausgewählter Mitglieder der ETK, sowie die Durchführung von Western Blot und Immunhistochemie.
Ergebnis: Die Metaanalyse der publizierten Microarrays zeigte, dass zahlreiche Mitglieder der ETK eine Dysregulation der RNA aufweisen. Zunächst wurde in einer Kohorte mit 10 normal und 20 ccRCC Geweben eine Untersuchung von 34 potentiell dysregulierten RNAs mittels PCR durchgeführt; es konnten konkordant zur Microarray Analyse alle 34 RNAs als differentiell exprimiert bestätigt werden. Zur weiteren internen Validierung wurden 18 RNAs in einer ergänzenden unabhängigen Kohorte (37 Normal- und 75 ccRCC Gewebe) mittels PCR untersucht. Alle 18 RNAs wiesen wie erwartet eine signifikant verminderte Expression im ccRCC Gewebe auf. Zur weiterführenden Untersuchung wurden 7 Gene ausgewählt, welche aktuell mit Western Blot und Immunhistochemie (Tissue Microarray) auf Protein Ebene evaluiert werden; erste Färbungen deuten ebenfalls auf eine Herabregulation der Proteinexpression hin.
Schlussfolgerung: Die bisherigen Ergebnisse deuten auf eine verminderte Expression zahlreicher Mitglieder der ETK hin; dies könnte Ursache einer reduzierten ATP Synthese in Mitochondrien von ccRCC Zellen sein.