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Genetische Veränderungen im gesunden Plattenepithel des Ösophagus von Patienten mit Barrett-Ösophagus und Barrett-Carcinom wurden in den letzten Jahren beschrieben. Eine vergleichende Genexpressionsanalyse mit normalem Plattenephitel des Ösophagus einer gesunden Kontrollgruppe ohne gastroösophagealen Reflux wurde bis dato nicht berichtet. Wir untersuchten deshalb, ob eindeutige Unterschiede in der Genexpression des histomorphologisch normalen Plattenepithels des Ösophagus von gesunden Patienten, Patienten mit Barrett-Ösophagus oder Barrett-Carcinom bestehen und ob damit eine molekulare Charakterisierung dieser Patientengruppen möglich ist.

Mittels quantitativer real-time RT-PCR (TaqManâ) wurde die mRNA Expression von 23 Genen ( ODC, CDX2, DNMT1, DNMT3a, DNMT3b, RARalpha, RARgamma, RXRalpha, RXRbeta, RXRgamma, BFT, GSTPI, COX1, COX2, DPD, SPARC, BCL2, TP, BAX, DAPK, TM4SF3, TSPAN, VEGF) in Relation zum internen Referenzgen b-Actin in insgesamt 49 Proben aus histomorphologisch normalem Plattenepithel des Ösophagus nachfolgender Patientengruppen untersucht: 19 Patienten mit Barrett-Ösophagus (BE-Gruppe), 20 Patienten mit Barrett-Carcinom (AC-Gruppe) und einer Kontrollgruppe (KG-Gruppe) gesunder Probanden. Für jede Probe wurde das gesamte Genspektrum dreifach analysiert, wozu 3528 PCR-Reaktionen notwendig waren. Die statistische Auswertung der unterschiedlichen Genexpressionen erfolgte mittels nicht-parametrischer Tests. Die Identifikation von Unterschieden in Genexpressionsprofilen zwischen den einzelnen Gruppen erfolgte durch logistische Regressionsanalyse und lineare Diskriminationsanalyse.

Die mediane Genexpression war für folgende Gene signifikant unterschiedlich im histomorphologisch normalen Plattenepithel in den 3 Patientengruppen: Bax (P=0.002), BFT (P=0.001), CDX2 (P=0.005), COX2 (P=0.042), DAPK (P=0.2), DNMT1 (P< 0.001), GSTPI (P=0.003), RARalpha (P=0.042), RARgamma (P< 0.001), RXRalpha (P=0.002), RXRbeta (P=0.008), SPARC (P=0.039), TSPAN (P=0.041), VEGF (P=0.006). Die lineare Diskriminationsanalyse ergab einen Cluster von 3 genetisch verschiedenen Gruppen mit einer eindeutigen molekularen Differenzierung (Fehlerrate 0.1) zwischen normalem Plattenepithel der CG-Gruppe, der BE-Gruppe und der AC-Gruppe (Cross-Validierungs-Analyse).

Diese Untersuchung berichtet erstmalig über eine parallele Analyse multipler Gene im histomorphologisch normalen Plattenepithel des Ösophagus von Patienten mit Barrett-Ösophagus, Barrett-Carcinom und einer gesunden Kontrollgruppe mittels quantitativer real-time RT-PCR. Unsere Ergebnisse verdeutlichen, dass signifikante mRNA Expressionsunterschiede einer Vielzahl von Genen in normalem Plattenepithel des Ösophagus zwischen den 3 Patientenkollektiven bestehen. Die Analyse der mRNA Expression multipler Gene in normalem Plattenepithel des Ösophagus erscheint ein vielversprechender Ansatz zur weiteren molekularen Charakterisierung von Barrett-Ösophagus und Barrett-Carcinom zu sein.