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Die Bedeutung von tRNA-Fragmenten als prognostischer Marker des Prostatakarzinoms
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Authors
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J. Ellinger
- Universitätsklinikum Bonn, Klinik und Poliklinik für Urologie und Kinderurologie, Bonn, Germany
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C. Zhao
- Universitätsklinikum Bonn, Klinik und Poliklinik für Urologie und Kinderurologie, Bonn, Germany
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Y. Tolkach
- Universitätsklinikum Bonn, Institut für Pathologie, Bonn, Germany
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G. Kristiansen
- Universitätsklinikum Bonn, Institut für Pathologie, Bonn, Germany
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S.C. Müller
- Universitätsklinikum Bonn, Klinik und Poliklinik für Urologie und Kinderurologie, Bonn, Germany
| Published: | February 15, 2018 |
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Fragstellung: Nicht-kodierende RNA Moleküle spielen eine wichtige Rolle in der Karzinogese vieler Malignome. Kürzlich wurde eine Dysregulation von tRNA-Fragmenten in Tumorzelllinien beschrieben, unter anderem auch in Androgen-Rezeptor exprimierenden Prostatakarzinom (PCA) Zellen. Ziel der Studie ist die Untersuchung von tRNA-Hälften in Gewebe und Serum von PCA Patienten um die Bedeutung als diagnostischen und prognostischen Marker zu evaluieren.
Methodik: Es erfolgte die Isolation der Gesamt-RNA aus Formalin-fixierten, in Paraffin eingebetteten Geweben (58 PCA, 25 BPH), sowie der zellfreien Serum RNA von 49 Patienten mit einem lokal-begrenzten PCA und 21 Patienten mit einem Kastrationsrefraktären PCA. Zur spezifischen Amplifikation von 3'/5'-tRNA-Hälften erfolgte die Ligation eines Adapter Moleküls anstelle des Phosphat-Rest des tRNA-Fragments. In der Folge kann durch entsprechendes Primer-Design eine quantitative Real-Time PCR zur Quantifizierung der relativen Expression der 5'-tRNA-Asp-GUC-, 5'-tRNA-His-GUG-, 5'-tRNA-Glu-CUC-, 5'-tRNA-Lys-CUU- und 3'-tRNA-Asp-GUC-Hälften erfolgen. Es erfolgte eine Korrelation der Expressionslevel mit den klinisch-pathologischen Parametern und dem PSA-spezifischen Überleben nach radikaler Prostatektomie.
Ergebnis: 5'-tRNA-Asp-GUC- and 3'-tRNA-Asp-GUC-halves zeigten eine signifikante Überexpression in PCA Gewebe im Vergleich zu BPH Gewebe. Eine erhöhte Expression von 5'-tRNA-Asp-GUC-, 5'-tRNA-His-GUG-, 5'-tRNA-Glu-CUC-, 5'-tRNA-Lys-CUU- und 3'-tRNA-Asp-GUC-Hälften war mit prognostisch ungünstigen pathologischen Parametern (pT4-Stadium; Lymphknoten-Metastasen) assoziiert. Kaplan Meier Analysen zeigten, das 5'-tRNA-Asp-GUC- and 5'-tRNA-Glu-CUC-Hälften prädiktiv für ein frühes PSA Rezidiv nach radikaler Prostatektomie waren. Zudem konnten im Serum 5'-tRNA-His-GUG-, 5'-tRNA-Glu-CUC- und 3'-tRNA-Asp-GUC-Hälften nachgewiesen werden; für die 5'-tRNA-Glu-CUC-Hälften konnten erhöhte Konzentrationen im CRPC festgestellt werden.
Schussfolgerung: Unsere Studie zeigt, dass Patienten mit einem fortgeschrittenen PCA eine erhöhte Expression von tRNA-Hälften aufweisen, und dies mit einer ungünstigen Prognose einhergeht.
